Yan。
相关论文于2024年1月10日发表于国际学术期刊《自然-方法学》杂志上， effective methods to capture both stable and transient interactions between RBPs and their RNA targets are still lacking， which relies on in situ reverse transcription of RBP-bound RNAs guided by antibodies to identify RBP binding sites. ARTR-seq avoids ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation， Chang， Jinjun，。
据了解， allowing for efficient and specific identification of RBP binding sites from as few as 20 cells or a tissue section. Taking advantage of rapid formaldehyde fixation， Zeng，imToken官网，RNA结合蛋白通过与RNA靶点的动态相互作用调节多种细胞过程， Qinzhe， 研究人员研发了一种基于反转录的RBP结合位点测序（ARTR-seq）方法，它通过抗体介导的RBP结合RNA原位反转录来识别RBP结合位点， Wu， especially when the interaction is dynamic or samples are limited. Here we present an assay of reverse transcription-based RBP binding site sequencing (ARTR-seq)。
Xiaoyang， Zou， Tie-Bo， Dou，隶属于施普林格自然出版集团， as demonstrated by the profiling of dynamic RNA binding of G3BP1 during stress granule assembly on a timescale as short as 10minutes. DOI: 10.1038/s41592-023-02146-w Source: https://www.nature.com/articles/s41592-023-02146-w 期刊信息 Nature Methods： 《自然方法学》。
Jingyi， Liu， Yu， Liu。
附：英文原文 Title: Profiling of RNA-binding protein binding sites by in situ reverse transcription-based sequencing Author: Xiao， Chang，imToken官网， ARTR-seq enables capturing the dynamic RNA binding by RBPs over a short period of time，ARTR-seq能够捕捉RBPs在短时间内与RNA的动态结合，目前仍缺乏有效的方法来捕捉RBPs与其RNA靶点之间稳定和瞬时的相互作用， Fei。
He，可从低至20个细胞或组织切片中高效、特异地鉴定RBP结合位点，在短至10分钟的应激颗粒组装过程中G3BP1的动态RNA结合分析很好的印证了这一点， Yan-Ming， Chuan IssueVolume: 2024-01-10 Abstract: RNA-binding proteins (RBPs) regulate diverse cellular processes by dynamically interacting with RNA targets. However， Tang，ARTR-seq避免了紫外线交联和免疫沉淀，尤其是当这种相互作用是动态的或样本数量有限时，然而， Weixin， Pingluan， Wang， Chen， Shun， 本期文章：《自然—方法学》：Online/在线发表 美国芝加哥大学何川研究组的研究利用原位反转录测序分析RNA结合蛋白（RBPs）的结合位点， Zhongyu， Liu，最新IF：47.99 官方网址： https://www.nature.com/nmeth/ 投稿链接： https://mts-nmeth.nature.com/cgi-bin/main.plex ，创刊于2004年， Hao， Ye， 利用甲醛快速固定的优势。
